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PRALINE sequence alignment results for job Example_4

Back to PRALINE main page
 
The PRALINE alignment process was completed in 3281.0 seconds.

Alignment score = 278418.25
Alignment score per aligned residue pair = 11.14
Sequence identities = 5076
Percent sequence identity = 0.20
Number of sequences = 12
Alignment length = 497
Number of residues = 4896
Number of gaps = 1068



Download the final alignment [p450.msf]
Download PRALINE raw output file [results.out]
Download PSI-BLAST output files
Download Secondary structure prediction files

 

 

Results colour-coded for amino acid conservation

The current colourscheme of the alignment is for amino acid conservation.

           

The conservation scoring is performed by PRALINE. The scoring scheme works from 0 for the least conserved alignment position, up to 10 for the most conserved alignment position.
The colour assignments are:

Unconserved 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Conserved


  . . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50
1n97a m k r l s l r e a w p y l k d l q - - - - - - - - - - - - - - q d p l a v l l a w g r a h - - p r l
1io7a - m y d w f s e m r k k d p v y y - - - - - - - - - - - - - - d g n i w q v f s y r y t k - - - e v
1gwia - - - - a r i p - - l d - p f v t d - - - - - - - - - - - - l d g e s a r l r a a g - p - - - l a a
1jfba - - - a p s f p - - f s r a s g p e - - - - - - - - - - - - p p a e f a k l r a t n - p - - - v s q
1jipa - - - - t t v p d l e s d s f h v d - - - - - - - - - - - - w y r t y a e l r e t a - p - - - v t p
1lfka - - - - - - - d p r p l h i r r q g - - - - - - - - - - - - l - d p a d e l l a a g - a - - - l t r
1n40a - - - a t v l l e v p f s a r g d r - - - - - - - - - - - - i p d a v a e l r t r e - p - - - i r k
1cpt m d a r a t i p e h i a r t v i l p - q g y a d d e v - - - i y p a f k w l r d e q - p - - - l a m
1qmqa - a n l a p l p p h v p e h l v f d f d m y n p s n l s a g v q e a w a v l q e s n v p d - - l v w
1jpza t i k e m p q p k t f - - g e l k n l p l l n - - - - - - - t d k p v q a l m k i a d e l g e i f k
1dt6a p p g p t p f p - - - - - - i i g n i l q i d - - - - - - - a k d i s k s l t k f s e c y g p v f t
1e9xa - m s a v a l p r v s g g h d e h g h l e e f - - - - - - - r t d p i g l m q r v r d e c g d v g t
Consistency0 1 1 1 3 2 3 5 2 1 2 2 1 2 3 3 2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 4 4 4 4 3 8 4 4 3 4 0 4 0 0 0 5 3 3
 
  . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100
1n97a f l p l p r f p l a l i f d p e g v e g a l l a e g t t k a t f - - - - - - - - q y r a l s r l t g
1io7a l n n f s k f s s d l t g y h e r l e d l - - - - r n g k i r f - - - - - - - - d i p t r y t m - -
1gwia v e l p g g v p v w a v t h h a e a k a l l t d p r l v k d i n v w g a w r r g e i p a d w p l i g
1jfba v k l f d g s l a w l v t k h k d v c f v a t s e k l s k v r t r - q g f p - - e l s a s g k q a a
1jipa v r f l - g q d a w l v t g y d e a k a a l s d l r l s s d p k k k y p g v e v e f p a y l g f p e
1lfka v t a - - - e t h w m a t a h a v v r q v m g d h q q f s t - - r r r w d p - - e l v - - - - - - g
1n40a v r t i t g a e a w l v s s y a l c t q v l e d r r f s m k e t a a a g a p - - r l n a l t v p p e
1cpt a h i e g y d p m w i a t k h a d v m q i g k q p g l f s n a e g s e i l y d q n n e a f m r s i s
1qmqa t r c n g - - g h w i a t r g q l i r e a y e d y r h f s - - - - - - - - - - - s e c p f i p r e a
1jpza f e a p - g r v t r y l s s q r l i k e a c d e s r f d k n l s q - - - - - - - a l k f v r d f a g
1dt6a v y l g - m k p t v v l h g y e a v k e a l v d l g e e f a g r g - - - - - - - s v p i l e k v s -
1e9xa f q l a - g k q v v l l s g s h a n e f f f r a g d d d l d q a k - - - - - - - a y p f m t p i f -
Consistency5 4 3 2 1 3 2 3 4 4 6 6 5 3 4 4 3 5 4 4 5 3 2 4 2 5 3 3 5 3 2 2 2 0 0 0 0 0 0 0 5 4 3 4 3 2 2 3 2 2
 
  . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150
1n97a r g l l - - - - - - - t d w g e s w k e a r k a l k d p f l p k n v - - r g y r e a m e e e a r a f
1io7a - - - l - - - - - - - t s d p p l h d e l r s m s a d i f s p q k l - - q t l e t f i r e t t r s l
1gwia l a n p g r - - s m l t v d g a e h r r l r t l v a q a l t v r r v - - e h m r g r i t e l t d r l
1jfba k a k p - - - - t f v d m d p p e h m h q r s m v e p t f t p e a v - - k n l q p y i q r t v d d l
1jipa d v r n y f a t n m g t s d p p t h t r l r k l v s q e f t v r r v - - e a m r p r v e q i t a e l
1lfka n l m - - - - - - - - d y d p p e h t r l r r k l t p g f t l r k m - - q r m a p y i e q i v n d r
1n40a v v n - - - - - - - - n m g n i a d a g l r k a v m k a i - t p k a - - p g l e q f l r d t a n s l
1cpt g g c p h v i d s l t s m d p p t h t a y r g l t l n w f q p a s i - - r k l e e n i r r i a q a s
1qmqa g e a y d f i - - p t s m d p p e q r q f r a l a n q v v g m p v v - - d k l e n r i q e l a c s l
1jpza d g l f - - - - - t s w t h e k n w k k a h n i l l p s f s q q a m - - k g y h a m m v d i a v q l
1dt6a k g l g - - - - - i a f s n a k t w k e m r r f s l m t l r n f g m g k r s i e d r i q e e a r c l
1e9xa - g e g - - - - - v v f - d a s p e r r k e m l h n a a l r g e q m - - k g h a a t i e d q v r r m
Consistency2 3 2 1 0 0 0 0 0 1 1 4 3 5 4 4 4 4 4 4 4 8 4 5 4 3 4 3 6 3 3 4 4 6 0 0 5 4 5 5 3 3 8 5 6 4 6 3 4 6
 
  . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200
1n97a f g e w r g e - - - - - e r d l d h e m l a l s l r l l g r a l f g - - - - - - - - - - k p l s p s
1io7a l d s i d p r - - - - - e d d i v k k l a v p l p i i v i s k i l g - - - - - - - - - - l p i e d k
1gwia l d e l p a d g - - - g v v d l k a a f a y p l p m y v v a d l m g - - - - - - - - - - i e e a r l
1jfba l e q m k q k g c a n g p v d l v k e f a l p v p s y i i y t l l g - - - - - - - - - - v p f n d l
1jipa l d e v g d s g - - - - v v d i v d r f a h p l p i k v i c e l l g - - - - - - - - - - v d e k y r
1lfka l d e m e r a g - - - s p a d l i a f v a d k v p g a v l c e l v g - - - - - - - - - - v p - r d d
1n40a l d n l i t e g - - - a p a d l r n d f a d p l a t a l h c k v l g - - - - - - - - - - i p q e d g
1cpt v q r l l d f d - - - g e c d f m t d c a l y y p l h v v m t a l g - - - - - - - - - - v p e d d e
1qmqa i e s l r p q - - - - g q c n f t e d y a e p f p i r i f m l l a g - - - - - - - - - - l p e e d i
1jpza v q k w e r l n a - - d e h i e v p e d m t r l t l d t i g l c g f n y r f n s f y r d q p h p f i
1dt6a v e e l r k t n a - - s p - c d p t f i l g c a p c n v i c s v i f h n - - - - - r f d y k d e e f
1e9xa i a d w g e a g e - - i d - l l - d f f a e l t i y t s s a c l i g k k - - - - - f r d q l d g r f
Consistency7 5 5 5 3 3 3 3 0 0 0 2 4 2 5 5 3 3 3 4 7 3 3 5 5 3 3 6 4 3 3 6 5 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 5 3 4 4 3
 
  . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250
1n97a l a e h a l k a l d r i m a - - q - - - - - - - - - - t r s p l a l l - - d l a a e a r f r k d r g
1io7a e k f k e w s d l v a f r l - - g - - - - - - - - - - k p g e i f e l g k k y l e l i g y v k d h l
1gwia p r l k v l f e k f f s t q t - p - - - - - - - - - - p e e v v a t l t e l a s i m t d t v a a k r
1jfba e y l t q q n a i r t n g s s - t - - - - - - - - - - a r e a s a a n q e l l d y l a i l v e q r l
1jipa g e f g r w s s e i l v m d p e r - - - - - - - - - - a e q r g q a a r e v v n f i l d l v e r r r
1lfka r d m f m k l c h g h l d a s l s - - - - - - - - - - q k r r a a l g d k f s r y l l a m i a r e r
1n40a p k l f r s l s i a f m s s a d p - - - - - - - - - - i p a a k i n w d r d i e y m a g i l e n p n
1cpt p l m l k l t q d f f g v e - - a - - - - - - - - - - a r r f h e t i a t f y d y f n g f t v d r r
1qmqa p h l k y l t d q m t r p d - - g - - - - - - - - - - s m t f a e a k e a l y d y l i p i i e q r r
1jpza t s m v r a l d e a m n k l q r a n p d d p a y d e n k r q f q e d i k v m n d l v d k i i a d r k
1dt6a l k l m e s l h e n v e l l g t p l d y f p - - - g i h k t l l k n a d y i k n f i m e k v k e h q
1e9xa a k l y h e l e r g t d p l a y v d p y l p i - - e s f r r r d e a r n g l v a l v a d i m n g r i
Consistency3 4 6 3 4 3 4 4 3 3 3 3 3 4 1 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 5 4 3 3 4 4 3 3 3 4 3 4 4 6 4 3 4 6 4 4 5 4
 
  . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300
1n97a a l - - - - - - y r e a e a l i v h p p l s - - - - h l p r e r a l s e a v t l l v a g h e t v a s
1io7a n s - - - - - - g t e v v s r v v n - - - s - - - - n l s d i e k l g y i i l l l i a g n e t t t n
1gwia a a p - - - - - g d d l t s a l i q a s e n g d - - h l t d a e i v s t l q l m v a a g h e t t i s
1jfba v e p - - - - - k d d i i s k l c t e q v k p g - - n i d k s d a v q i a f l l l v a g n a t m v n
1jipa t e p - - - - - g d d l l s a l i r v q d d d d g - r l s a d e l t s i a l v l l l a g f e s s v s
1lfka k e p - - - - - g e g m i g a v v a e y g d - - - - d a t d e e l r g f c v q v m l a g d d n i s g
1n40a i t t g l - - - m g e l s r l r k d p a y s - - - - h v s d e l f a t i g v t f f g a g v i s t g s
1cpt s c p - - - - - k d d v m s l l a n s k l d g n - - y i d d k y i n a y y v a i a t a g h d t t s s
1qmqa q k p - - - - - g t d a i s i v a n g q v n g r - - p i t s d e a k r m c g l l l v g g l d t v v n
1jpza a s q - - - - - s d d l l t h m l n g k d p e t g e p l d d e n i r y q i i t f l i a g h e t t s g
1dt6a k l l d v n n p r d f i d c f l i k m e q e n n l - e f t l e s l v i a v s d l f g a g t e t t s t
1e9xa a n p p t d k s d r d m l d v l i a v k a e t g t p r f s a d e i t g m f i s m m f a g h h t s s g
Consistency4 3 4 0 0 0 0 0 3 4 6 6 4 5 4 6 5 4 2 3 2 5 1 1 0 0 3 6 5 4 5 4 5 4 3 3 3 4 4 6 6 4 9 * 3 5 7 5 5 5
 
  . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350
1n97a a l t w s f l l l s h r p d w q k r v a e s e e a a - - - - - - - - - - - - - - - - - - l a a f q e
1io7a l i s n s v i d f t r - f n l w q r i r e - e n l y - - - - - - - - - - - - - - - - - - l k a i e e
1gwia l i v n a v v n l s t h p e q r a l v l s g e a e w - - - - - - - - - - - - - - - - - - s a v v e e
1jfba m i a l g v a t l a q h p d q l a q l k a n p s l a - - - - - - - - - - - - - - - - - - p q f v e e
1jipa l i g i g t y l l l t h p d q l a l v r r d p s a l - - - - - - - - - - - - - - - - - - p n a v e e
1lfka m i g l g v l a m l r h p e q i d a f r g d e q s a - - - - - - - - - - - - - - - - - - q r a v d e
1n40a f l t t a l i s l i q r p q l r n l l h e k p e l i - - - - - - - - - - - - - - - - - - p a g v e e
1cpt s s g g a i i g l s r n p e q l a l a k s d p a l i - - - - - - - - - - - - - - - - - - p r l v d e
1qmqa f l s f s m e f l a k s p e h r q e l i e r p e r i - - - - - - - - - - - - - - - - - - p a a c e e
1jpza l l s f a l y f l v k n p h v l q k a a e e a a r v l v d - p v p s y k q v k q l k y v g m v l n e
1dt6a t l r y s l l l l l k h p e v a a r v q e e i e r v i g r h r s p c m q d r s r m p y t d a v i h e
1e9xa t a s w t l i e l m r h r d a y a a v i d e l d e l y g d g r s v s f h a l r q i p q l e n v l k e
Consistency4 6 4 3 6 6 5 3 8 5 5 4 7 6 4 3 5 4 6 4 5 4 4 5 4 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 4 5 6 6 *
 
  . . . . . . . . . 360 . . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400
1n97a a l r l y p p a w i - l t r r l e r p l l l - g e d r l p p g t t l v l s p y v t q r l h f p d g e
1io7a a l r y s p p v m r - t v r k t k e r v k l - g d q t i e e g e y v r v w i a s a n r - - - - d e e
1gwia t l r f s t p t s h v l i r f a a e d v p v - g d r v i p a g d a l i v s y g a l g r - - - - d e r
1jfba l c r y h t a s a l a i k r t a k e d v m i - g d k l v r a n e g i i a s n q s a n r - - - - d e e
1jipa i l r y i a p p e - t t t r f a a e e v e i - g g v a i p q y s t v l v a n g a a n r - - - - d p k
1lfka l i r y l t v p y s p t p r i a r e d l t l - a g q e i k k g d s v i c s l p a a n r - - - - d p a
1n40a l l r i n l s f a d g l p r l a t a d i q v - g d v l v r k g e l v l v l l e g a n f - - - - d p e
1cpt a v r w t a p v k s - f m r t a l a d t e v - r g q n i k r g d r i m l s y p s a n r - - - - d e e
1qmqa l l r r f s l v a - - d g r i l t s d y e f - h g v q l k k g d q i l l p q m l s g l - - - - d e r
1jpza a l r l w p t a - p a f s l y a k e d t v l g g e y p l e k g d e l m v l i p q l h r - - - - d k t
1dt6a i q r f i d l l p t n l p h a v t r d v r f - r n y f i p k g t d i i t s l t s v l h - - - - d e k
1e9xa t l r l h p p l - i i l m r v a k g e f e v - q g h r i h e g d l v a a s p a i s n r - - - - i p e
Consistency5 6 * 4 3 4 4 4 2 2 1 4 3 7 3 6 4 5 6 5 4 6 0 5 5 3 3 8 4 5 7 6 3 8 6 5 5 3 3 4 6 5 6 0 0 0 0 8 5 5
 
  . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420 . . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450
1n97a a f - - r p e r f l e e r g t p s g r - - - - - - - - y f p f g l g q r l c l g r d f a l l e g p i
1io7a v f - h d g e k f i p d r - n p n - p - - - - - - - - h l s f g s g i h l c l g a p l a r l e a r i
1gwia a h g p t a d r f d l t r t - s g n r - - - - - - - - h i s f g h g p h v c p g a a l s r m e a g v
1jfba v f - e n p d e f n m n r k w p p q d - - - - - - - - p l g f g f g d h r c i a e h l a k a e l t t
1jipa q f - p d p h r f d v t r d - - t r g - - - - - - - - h l s f g q g i h f c m g r p l a k l e g e v
1lfka l a - p d v d r l d v t r - - e p i p - - - - - - - - h v a f g h g v h h c l g a a l a r l e l r t
1n40a h f - p n p g s i e l d r p - n p t s - - - - - - - - h l a f g r g q h f c p g s a l g r r h a q i
1cpt v f - s n p d e f d i t r - - f p n r - - - - - - - - h l g f g w g a h m c l g q h l a k l e m k i
1qmqa e n - a a p m h v d f s r - - q k v s - - - - - - - - h t t f g h g s h l c l g q h l a r r e i i v
1jpza i w g d d v e e f r p e r f e n p s a - - - i p q h a f k p f g n g q r a c i g q q f a l h e a t l
1dt6a a f - p n p k v f d p g h f l d e s g n f k k s d - y f m p f s a g k r m c v g e g l a r m e l f l
1e9xa d f - p d p h d f v p a r y e q p r q e d l l n r w t w i p f g a g r h r c v g a a f a i m q i k a
Consistency4 5 0 4 5 5 4 4 7 4 3 4 8 1 0 3 4 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 5 5 4 * 9 3 * 3 7 4 * 5 9 5 3 7 8 5 5 8 4 3 6
 
  . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480 . . . . . . . . . 490 . . . . . . .
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