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PRALINE sequence alignment results for job Example_6

Back to PRALINE main page
 
The PRALINE alignment process was completed in 3285.0 seconds.

Alignment score = 221556.00
Alignment score per aligned residue pair = 8.89
Sequence identities = 4983
Percent sequence identity = 0.20
Number of sequences = 12
Alignment length = 501
Number of residues = 4896
Number of gaps = 1116



Download the final alignment [p450.msf]
Download PRALINE raw output file [results.out]
Download PSI-BLAST output files
Download Secondary structure prediction files

 

Results colour-coded for amino acid conservation

The current colourscheme of the alignment is for amino acid conservation.

         

The conservation scoring is performed by PRALINE. The scoring scheme works from 0 for the least conserved alignment position, up to 10 for the most conserved alignment position.
The colour assignments are:

Unconserved 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Conserved


  . . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50
1n97a - - - - - M K - R L S L R E - - - A W P Y L K D L Q Q D - P L A V L L A W G R A H P R L F - - - - -
1jpza - - - - T I K - E M P Q P K T F G E L K N L P L L N T D K P V Q A L M K I A D E L G E I F - - - - -
1e9xa - - M S A V A - L P R V S G G H D E H G H L E E F R T D - P I G L M Q R V R D E C G D V G - - - - -
1dt6a - - - - - - - - - P P G P T P F P I I G N I L Q I D A K D I S K S L T K F S E C Y G P V F - - - - -
1gwia - - - - - - - - - - - - - - - - - A R I - P L D P F V T D L D G E S A R L R A A G P L A A - - - - -
1jipa - - - - - - - - - - - - - - T T V P D L - E S D S F H V D W Y R T Y A E L R E T A P V T P - - - - -
1jfba - - - - - - - - - - - - - - - - A P S F P F S R A S G P E P P A E F A K L R A T N P V S Q - - - - -
1n40a - - - - - - - - - - - - - A T V L L E V P F - S A R G D R I P D A V A E L R T R E P I R K - - - - -
1cpt - - M D - A R A T I P E H I A R T V I L P Q G Y A D D E V I Y P A F K W L R D E Q P L A M - - - - -
1qmqa A N L A P L P P H V P E H L V F D F D M Y N P S N L S A G V Q E A W A V L Q E S N V P D L - - - - -
1lfka - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D P R P L H I R R Q G L D P A D E L L A A G
1io7a - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M Y D W F S E M R K K D P V - - - - - - -
Consistency0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 4 2 3 4 4 4 4 5 6 4 4 2 5 3 3 2 0 0 0 0 0
 
  . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100
1n97a - L P L - P R F P L A L I F D P E G V E G A L L A - E G T T K A T F Q - - - - - - - - - - - - - Y R
1jpza - K F E A P G R V T R Y L S S Q R L I K E A C D E S R F D K N L S Q A - - - - - - - - - - - - - L K
1e9xa - T F Q L A G K Q V V L L S G S H A N E F F F R A G D D D L D Q A K A - - - - - - - - - - - - - Y P
1dt6a - T V Y L G M K P T V V L H G Y E A V K E A L V D L G E E F A G R G S - - - - - - - - - - - - - V P
1gwia - V E L P G G V P V W A V T H H A E A K A L L T D P R L V K D I N V W G A W R R G E I P - - A D W P
1jipa - V R F L - G Q D A W L V T G Y D E A K A A L S D L R L S S D P K K K Y P G V E V E F P A Y L G F P
1jfba - V K L F D G S L A W L V T K H K D V C F V A T S E K L S K V R T R Q G F P E - - - - - - - L S A S
1n40a - V R T I T G A E A W L V S S Y A L C T Q V L E D R R F S M K E T A A A G A P - - - - - - - - - - R
1cpt - A H I E G Y D P M W I A T K H A D V M Q I G K Q P G L F S N A E G S E I L Y D Q N N E A F M R S I
1qmqa - V W T R C N G G H W I A T R G Q L I R E A Y E D Y R H F S S E C P F - - - - - - - - - - - - - I P
1lfka A L T R V T A E T H W M A T A H A V V R Q V M G D H Q Q F S T - - - - - - - - - - - - - - - - - - R
1io7a - Y Y D - - - G N I W Q V F S Y R Y T K E V L N N F S K F S S D L T G Y H E R L E D L - - - R N G K
Consistency0 5 2 3 2 2 3 3 3 4 5 5 6 5 4 4 4 3 5 5 4 6 4 3 5 2 4 3 3 4 4 2 3 2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 4
 
  . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150
1n97a A L S R L T - G R G L L T D - - W G E S W K E A R K A - L K D P F L P K N - V R G Y R E A M E E E A
1jpza F V R D F A - G D G L F T S W T H E K N W K K A H N I - L L P S F S Q Q A - M K G Y H A M M V D I A
1e9xa F M T P I F - G E G V V F - - - D A S P E R R K E M L - H N A A L R G E Q - M K G H A A T I E D Q V
1dt6a I L E K V S K G L G I A F S - - N A K T W K E M R R F S L M T L R N F G M G K R S I E D R I Q E E A
1gwia L I G L A N P G R S M L T V - - D G A E H R R L R T L - V A Q A L T V R R - V E H M R G R I T E L T
1jipa E D V R N Y F A T N M G T S - - D P P T H T R L R K L - V S Q E F T V R R - V E A M R P R V E Q I T
1jfba G K Q A A K A K P T F V D M - - D P P E H M H Q R S M - V E P T F T P E A - V K N L Q P Y I Q R T V
1n40a L N A L T V P P E V V N N M - - G N I A D A G L R K A - V M K A I T P K - - A P G L E Q F L R D T A
1cpt S G G C P H V I D S L T S M - - D P P T H T A Y R G L - T L N W F Q P A S - I R K L E E N I R R I A
1qmqa R E A G E A Y D F I P T S M - - D P P E Q R Q F R A L - A N Q V V G M P V - V D K L E N R I Q E L A
1lfka R R W D P E L V G N L M D Y - - D P P E H T R L R R K - L T P G F T L R K - M Q R M A P Y I E Q I V
1io7a I R F D I P T R Y T M L T S - - D P P L H D E L R S M - S A D I F S P Q K - L Q T L E T F I R E T T
Consistency3 3 3 2 3 3 1 3 2 4 5 4 4 3 0 0 5 4 4 4 4 4 4 4 8 4 5 0 5 3 4 3 5 4 3 4 3 0 6 5 4 5 5 3 3 8 5 6 4 6
 
  . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200
1n97a R A F F G E W R G E - - - - - E R D - L D H E M L A L S L R L L G R A L F G - - K P L S P S - L A E
1jpza V Q L V Q K W E R L N A D E - H I E - V P E D M T R L T L D T I G L C G F N Y R F N S F Y R D Q P H
1e9xa R R M I A D W G E A - - - G - E I D - L L D F F A E L T I Y T S S A C L I G - - K K F R D Q - L D G
1dt6a R C L V E E L R K T N A - S - P C D P T F I - L G C A P C N V I C S V I F H N R F D Y - - - - K D E
1gwia D R L L D E L P A D G G - - - V V D L K A A F A Y P L P M Y V V A D L M G - - - - - - - - - - I E E
1jipa A E L L D E V G D S G - - - - V V D I V D R F A H P L P I K V I C E L L G - - - - - - - - - - V D E
1jfba D D L L E Q M K Q K G C A N G P V D L V K E F A L P V P S Y I I Y T L L G - - - - - - - - - - V P F
1n40a N S L L D N L I T E G A - - - P A D L R N D F A D P L A T A L H C K V L G - - - - - - - - - - I P Q
1cpt Q A S V Q R L L D F D G - - - E C D F M T D C A L Y Y P L H V V M T A L G - - - - - - - - - - V P E
1qmqa C S L I E S L R P - Q G - - - Q C N F T E D Y A E P F P I R I F M L L A G - - - - - - - - - - L P E
1lfka N D R L D E M E R A G S - - - P A D L I A F V A D K V P G A V L C E L V G - - - - - - - - - - V P R
1io7a R S L L D S I D P R E - - - - - D D I V K K L A V P L P I I V I S K I L G - - - - - - - - - - L P I
Consistency3 4 6 7 5 5 5 3 3 3 3 2 0 0 0 3 4 8 3 5 3 3 3 6 2 4 6 6 4 3 7 5 3 4 5 6 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 5 4
 
  . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250
1n97a H A L K A L D R I M A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q T R S P L A L L D L A A E A R F R
1jpza P F I T S M V R A L D E A M N K L Q R A N P D D P A Y D E N K R Q F Q E D I K V M N D L V D K I I A
1e9xa R F A K L Y H E L E R G T D P L A Y - - - V D P Y L P I E S F R R R D E A R N G L V A L V A D I M N
1dt6a E F L K L M E S L H E N V E L L G T P - - - - L D Y F P G I H K T L L K N A D Y I K N F I M E K V K
1gwia A R L P R L K V L F E K F F S T - Q T - - - - - - - - - - P P E E V V A T L T E L A S I M T D T V A
1jipa K Y R G E F G R W S S E I L V M D P E - - - - - - - - - - R A E Q R G Q A A R E V V N F I L D L V E
1jfba N D L E Y L T Q Q N A I R T N G - S S - - - - - - - - - - T A R E A S A A N Q E L L D Y L A I L V E
1n40a E D G P K L F R S L S I A F M S S A D - - - - - - - - - - P I P A A K I N W D R D I E Y M A G I L E
1cpt D D E P L M L K L T Q D F F G - - V E - - - - - - - - - - A A R R F H E T I A T F Y D Y F N G F T V
1qmqa E D I P H L K Y L T D Q M T R - - P D - - - - - - - - - - G S M T F A E A K E A L Y D Y L I P I I E
1lfka D D R D M F M K L C H G H L D A - S L - - - - - - - - - - S Q K R R A A L G D K F S R Y L L A M I A
1io7a E D K E K F K E W S D L V A F R - L G - - - - - - - - - - K P G E I F E L G K K Y L E L I G Y V K D
Consistency4 4 3 4 3 6 3 4 4 3 4 2 3 3 2 2 0 3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 3 5 3 3 5 3 3 4 3 5 3 4 5 6 3 3 5 5 4
 
  . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300
1n97a K D R G A - - - - - - - - L Y R E A E A L I V H - P P L S H - L P R E R A L S E A V T L L V A G H E
1jpza D R K A S Q - - - - - S D D L L T H M L N G K D P E T G E P - L D D E N I R Y Q I I T F L I A G H E
1e9xa G R I A N P P T D K S D R D M L D V L I A V K A - E T G T P R F S A D E I T G M F I S M M F A G H H
1dt6a E H Q K L L - D V N N P R D F I D C F L I K M E Q E N N L E - F T L E S L V I A V S D L F G A G T E
1gwia A K R A A P - - - - - G D D L T S A L I Q A S E N G - - D H - L T D A E I V S T L Q L M V A A G H E
1jipa R R R T E P - - - - - G D D L L S A L I R V Q D D D - D G R - L S A D E L T S I A L V L L L A G F E
1jfba Q R L V E P - - - - - K D D I I S K L C T E Q V K P - - G N - I D K S D A V Q I A F L L L V A G N A
1n40a N P N - - I - - - - - T T G L M G E L S R L R K D P A Y S H - V S D E L F A T I G V T F F G A G V I
1cpt D R R S C P - - - - - K D D V M S L L A N S K L D G - - N Y - I D D K Y I N A Y Y V A I A T A G H D
1qmqa Q R R Q K P - - - - - G T D A I S I V A N G Q V N G - - R P - I T S D E A K R M C G L L L V G G L D
1lfka R E R K E P - - - - - G E G M I G A V V A E Y G D - - - - D - A T D E E L R G F C V Q V M L A G D D
1io7a H L N - - S - - - - - G T E V V S R V V N S N - - - - - - - - L S D I E K L G Y I I L L L I A G N E
Consistency4 4 5 3 2 4 0 0 0 0 0 3 4 5 5 6 5 3 6 5 4 3 4 2 2 2 0 0 2 3 0 6 5 4 5 4 5 4 3 3 3 4 4 6 6 4 9 * 3 5
 
  . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350
1n97a T V A S A L T W S F L L L S H R P D W Q K R V A E S E E A A L - - - - - - - - - - - - - - - - - - A
1jpza T T S G L L S F A L Y F L V K N P H V L Q K A A E E A A R V L V D P V P - S Y K Q V K Q L K Y V G M
1e9xa T S S G T A S W T L I E L M R H R D A Y A A V I D E L D E L Y G D G R S V S F H A L R Q I P Q L E N
1dt6a T T S T T L R Y S L L L L L K H P E V A A R V Q E E I E R V I G R H R S P C M Q D R S R M P Y T D A
1gwia T T I S L I V N A V V N L S T H P E Q R A L V L S G E A E W - - - - - - - - - - - - - - - - - - S A
1jipa S S V S L I G I G T Y L L L T H P D Q L A L V R R D P S A L - - - - - - - - - - - - - - - - - - P N
1jfba T M V N M I A L G V A T L A Q H P D Q L A Q L K A N P S L A - - - - - - - - - - - - - - - - - - P Q
1n40a S T G S F L T T A L I S L I Q R P Q L R N L L H E K P E L I - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A
1cpt T T S S S S G G A I I G L S R N P E Q L A L A K S D P A L I - - - - - - - - - - - - - - - - - - P R
1qmqa T V V N F L S F S M E F L A K S P E H R Q E L I E R P E R I - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A
1lfka N I S G M I G L G V L A M L R H P E Q I D A F R G D E Q S A - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q R
1io7a T T T N L I S N S V I D F T R F N L W Q R I R E - - E N L Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - L K
Consistency7 5 5 5 4 6 4 3 6 6 5 3 8 5 5 5 7 5 3 4 5 4 5 3 4 4 4 5 4 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 4
 
  . . . . . . . . . 360 . . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400
1n97a A F Q E A L R L Y P P A W - I L T R R L E R P L L L - G E D R L P P G T T L V L S P Y V T Q R L H -
1jpza V L N E A L R L W P T A P - A F S L Y A K E D T V L G G E Y P L E K G D E L M V L I P Q L H R D K T
1e9xa V L K E T L R L H P P L I - I L M R V A K G E F E V - Q G H R I H E G D L V A A S P A I S N R I P E
1dt6a V I H E I Q R F I D L L P T N L P H A V T R D V R F - R N Y F I P K G T D I I T S L T S V L H D E K
1gwia V V E E T L R F S T P T S H V L I R F A A E D V P V - G D R V I P A G D A L I V S Y G A L G R D E R
1jipa A V E E I L R Y I A P P E T T T - R F A A E E V E I - G G V A I P Q Y S T V L V A N G A A N R D P K
1jfba F V E E L C R Y H T A S A L A I K R T A K E D V M I - G D K L V R A N E G I I A S N Q S A N R D E E
1n40a G V E E L L R I N L S F A D G L P R L A T A D I Q V - G D V L V R K G E L V L V L L E G A N F D P E
1cpt L V D E A V R W T A P V K S F M - R T A L A D T E V - R G Q N I K R G D R I M L S Y P S A N R D E E
1qmqa A C E E L L R R F S L V A - D G - R I L T S D Y E F - H G V Q L K K G D Q I L L P Q M L S G L D E R
1lfka A V D E L I R Y L T V P Y S P T P R I A R E D L T L - A G Q E I K K G D S V I C S L P A A N R D P A
1io7a A I E E A L R Y S P P V M R T V - R K T K E R V K L - G D Q T I E E G E Y V R V W I A S A N R D E E
Consistency5 6 6 * 5 6 * 4 3 4 4 4 3 1 3 5 1 7 3 6 4 5 6 5 4 6 0 5 5 3 3 8 4 5 7 6 3 8 6 5 5 3 3 4 6 5 6 7 5 4
 
  . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420 . . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450
1n97a - F P D G - E A F R P E R F L E E R G - - - T P S G R Y F P F G L G Q R L C L G R D F A L L E G P I
1jpza I W G D D V E E F R P E R F E N P S A - - - I P Q H A F K P F G N G Q R A C I G Q Q F A L H E A T L
1e9xa D F P D P - H D F V P A R Y E Q P R Q E D L L N R W T W I P F G A G R H R C V G A A F A I M Q I K A
1dt6a A F P N P - K V F D P G H F L D E S G N F - K K S D Y F M P F S A G K R M C V G E G L A R M E L F L
1gwia A H G P - - - - - T A D R F D L T R T - - - S - G N R H I S F G H G P H V C P G A A L S R M E A G V
1jipa Q F - P - - - - - D P H R F D V T R D - - - T - - R G H L S F G Q G I H F C M G R P L A K L E G E V
1jfba V F - E - - - - - N P D E F N M N R K - - - W P P Q D P L G F G F G D H R C I A E H L A K A E L T T
1n40a H F - P - - - - - N P G S I E L D R P - - - N - P T S H L A F G R G Q H F C P G S A L G R R H A Q I
1cpt V F - S - - - - - N P D E F D I T R F - - - P - - N R H L G F G W G A H M C L G Q H L A K L E M K I
1qmqa E N - A - - - - - A P M H V D F S R Q - - - K - - V S H T T F G H G S H L C L G Q H L A R R E I I V
1lfka L A - P - - - - - D V D R L D V T R E - - - P - - I P H V A F G H G V H H C L G A A L A R L E L R T
1io7a V F - H - - - - - D G E K F I P D R N - - - P - - N P H L S F G S G I H L C L G A P L A R L E A R I
Consistency3 5 0 4 0 0 0 0 0 4 6 4 5 7 4 3 4 8 3 0 0 0 3 0 1 3 3 5 5 4 * 9 3 * 3 7 4 * 5 9 5 3 7 8 5 5 8 4 3 6
 
  . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480 . . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500
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